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梅步俊 ,王志华 ( 河套学院农学系;河套学院土木工程系 ) - 出处: 黑龙江畜牧兽医(上半月) 2013 第11期 P52-54
- 关键词: 全基因组关联分析 消息传递接口 开放多线程 置换检验 数量性状基因座 并行计算
- 摘要: 为了解决全基因组关联分析假设检验方法的难题,试验对现有的置换检验方法进行改进,采用消息传递接口+开放多线程混合编程模型,实现线程和进程级并行计算,并进行模拟数据集测试.结果表明:随中央处理器数目增加其计算时间呈线性下降,数量性状基因座定位准确性与其他软件基本相同.
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浏览量:1
- 作者:
梅步俊 ,王志华 ( 河套学院农学系;河套学院土木工程系 ) - 出处: 黑龙江畜牧兽医(上半月) 2015 第9期 P95-97
- 关键词: 全基因组测序 基因组选择 育种值估计 育种方法 基因组育种值
- 摘要: 随着测序技术的发展,全基因组测序数据逐渐被应用到畜禽基因组选择中.基于全基因组测序的畜禽基因组选择方法不仅克服了已有基于单核苷酸多态性数据的许多缺陷,其数据模拟、分析方法也有许多特殊之处.目前,由于计算复杂性等问题,该领域在国内的研究尚处于起步阶段.文章简要介绍了该领域目前的一些研究进展.
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浏览量:1
- 作者:
梅步俊 ,王志华 ( 河套学院农学系;爱荷华州立大学动物科学系;河套学院土木工程系 ) - 出处: 黑龙江畜牧兽医(上半月) 2016 第11期 P38-44,293
- 关键词: 贝叶斯多元回归 全基因组关联分析 多重比较 动物育种 计算生物学
- 摘要: 为了研究贝叶斯统计在家畜全基因组关联分析中的应用,试验采用了贝叶斯多元回归方法,主要讨论其理论基础、处理SNPs间局部高相关性和后验I型错误率在控制GWAS中假阳性问题中的应用,并基于模拟数据来比较该方法的性质.结果表明:1)即使预测变量间存在由连锁不平衡导致的潜在相关性,BMR也可以成功地应用在全
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浏览量:1
- 作者:
梅步俊 ,王志华 ( 河套学院农学系;河套学院土木工程系 ) - 出处: 基因组学与应用生物学 2018 第8期 P3304-3312
- 关键词: 家畜 统计基因组 上位效应 全基因组分析 稀有变异
- 摘要: 下一代测序技术的出现和检测费用不断下降清除了稀有变异检测的技术障碍,可以检测出包括常见变异和稀有变异在内的数以千万的遗传变异,其中绝大部分的变异都是稀有变异。这种情况对统计分析方法和结果解释提出了新的挑战。当前最为流行的全基因组分析方法主要针对常见变异间上位效应的检测问题,家畜育种中较少涉及稀有变异
- 作者:
王志华 ( 河套学院土木工程系 ) - 出处: 建材与装饰 2018 第14期 P135-136
- 关键词: PSO-ANN模型 道路沉降 线性回归
- 摘要: 目前,道路沉降预测方法有很多,但每种方法的应用都存在一定的局限性,本文以湘桂某道路沉降预测分析为例,比较了PSO-ANN模型与线性回归沉降预测的准确性,探讨了适用性。结果表明,PSO-ANN模型后期沉降预测结果较准确,短期沉降预测结果具有一定的工程参考价值。
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被引量:1
- 作者:
梅步俊 ,王志华 ( 河套学院农学系;河套学院土木工程系 ) - 出处: 黑龙江畜牧兽医 2015 第17期 P95-97
- 关键词: 全基因组测序 基因组选择 育种值估计 育种方法 基因组育种值
- 摘要: 随着测序技术的发展,全基因组测序数据逐渐被应用到畜禽基因组选择中。基于全基因组测序的畜禽基因组选择方法不仅克服了已有基于单核苷酸多态性(SNP)数据的许多缺陷,其数据模拟、分析方法也有许多特殊之处。目前,由于计算复杂性等问题,该领域在国内的研究尚处于起步阶段。文章简要介绍了该领域目前的一些研究进展。
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被引量:3
- 作者:
梅步俊 ,王志华 ( 河套学院农学系;爱荷华州立大学动物科学系;河套学院土木工程系 ) - 出处: 基因组学与应用生物学 2016 第35卷 第10期 P2668-2675
- 关键词: 基因组评定 基因组选择 单步贝叶斯方法 动物育种 计算生物学
- 摘要: 随着标记信息可以被越来越多的应用在家畜育种中,许多基因组选择(GS)方法使得育种工作者可以利用家畜早期的基因型数据提前对其进行选择。结合系谱、表型和基因型数据,我们可以缩短家畜的世代间隔,提高家畜遗传价值估计的准确性,进而加速其遗传改良速度。近年来,和广泛使用的多步基因组选择策略相比,业界更推崇基于
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被引量:2
- 作者:
梅步俊 ,王志华 ( 河套学院农学系;河套学院土木工程系 ) - 出处: 基因组学与应用生物学 2014 第6期 P1211-1216
- 关键词: 畜禽 全基因组关联分析 贝叶斯因子 多重比较 多重检验 假设检验
- 摘要: 为了剔除畜禽全基因组关联分析结果中的假阳性结果,寻找最优的假设检验方法,解决畜禽全基因组关联分析中的多重比较问题,本研究将现有GWAS研究中常用的七种假设检验方法和贝叶斯因子法进行比较。通过对模拟数据和公开数据集的研究,结果表明:畜禽全基因组关联分析中用贝叶斯因子法进行假设推断,其优良的统计性能与假
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被引量:4
浏览量:1
- 作者:
梅步俊 ,王志华 ( 河套学院农学系;爱荷华州立大学动物科学系;河套学院土木工程系 ) - 出处: 基因组学与应用生物学 2016 第35卷 第4期 P788-796
- 关键词: 动物育种 计算生物学 全基因组关联 基因组选择 数量遗传学 Julia语言
- 摘要: 基因组测序技术的发展为我们提供了研究家畜重要经济性状遗传基础的契机。家畜和人类医学中的全基因组关联分析表明单个数量性状基因座(QTL)的效应是非常微小的。这一结论促使利用高密度单核苷酸多态性(SNP)信息进行基因组选择方法的研究。结合新的统计学方法,并检测基因组数据的特征无疑是进行基因组研究和实验设
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被引量:3
- 作者:
梅步俊 ,王志华 ( 河套学院农学系;河套学院土木工程系 ) - 出处: 安徽农学通报 2017 第23卷 第20期 P18-20,25
- 关键词: 教学改革 统计计算 数量遗传学 复杂性状
- 摘要: 数量遗传学是遗传学领域难度较大的课程,掌握数量遗传学基本知识,并能将其应用到科研工作中,从事相关研究,需要学生拥有较为扎实的统计学基础。但是,目前国内的统计学和数量遗传学教学尚缺乏联系。该文以数量遗传学基本概念为主要内容,较为详细的推导了数量遗传学的基本原理和公式,为学生进一步理解该学科的的基本原理
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被引量:4
王志华,女,汉族, 1978年12月出生,研究生学历,工学硕士、讲师。2007年毕业于内蒙古农业大学林业工程学院森林工程专业。
主讲课程:《土力学与地基基础》、《路基路面工程》、《公路工程造价》等。2014年,获内蒙古自治区人民政府颁发的以“三导向、双循环、四结合”为特色的人才培养模式创新研究与实践二等奖。